Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CNIH4Q9P003 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CNIH4Q9P003 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CNIH4Q9P003 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CNIH4Q9P003 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CNIH4Q9P003 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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