Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00597Q9H2U6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms