Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CEP44Q9C0F1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms