Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FOXQ1Q9C009 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXQ1Q9C009 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms