Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHMP4AQ9BY43 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHMP4AQ9BY43 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms