Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms