Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms