Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C18orf8Q96DM3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C18orf8Q96DM3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms