Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNDC1Q96C34 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms