Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERVK_113Q902F9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERVK_113Q902F9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms