Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SVOPQ8N4V2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms