Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHOT2Q8IXI1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOT2Q8IXI1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms