Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC6Q8IVU3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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