Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HDXQ7Z353 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms