Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FOXD4L3Q6VB84 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms