Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGAP9Q5VTM2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms