Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC01545Q5VT33 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms