Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA3Q53S33 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms