Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPHKAPQ2M3C7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPHKAPQ2M3C7 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
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