Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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