Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PFKFB3Q16875 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms