Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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