Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPE65Q16518 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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RPE65Q16518 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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RPE65Q16518 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPE65Q16518 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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