Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD5Q16401 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD5Q16401 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms