Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIK4Q16099 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms