Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NEDD8Q15843 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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NEDD8Q15843 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NEDD8Q15843 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NEDD8Q15843 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NEDD8Q15843 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NEDD8Q15843 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NEDD8Q15843 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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