Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCDC85BQ15834 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCDC85BQ15834 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCDC85BQ15834 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCDC85BQ15834 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCDC85BQ15834 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CCDC85BQ15834 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC85BQ15834 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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