Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKIV2LQ15477 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms