Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYCP1Q15431 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYCP1Q15431 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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