Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PCOLCEQ15113 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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