Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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COL4A6Q14031 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COL4A6Q14031 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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