Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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DDX39BQ13838 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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DDX39BQ13838 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DDX39BQ13838 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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