Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MTMR3Q13615 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MTMR3Q13615 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms