Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms