Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHAF1AQ13111 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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