Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM2Q13029 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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