Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXF2Q12947 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms