Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARHGEF5Q12774 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms