Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDE4DQ08499 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms