Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNB2Q08289 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNB2Q08289 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms