Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TFF3Q07654 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms