Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms