Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APBA1Q02410 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms