Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
DEFA6Q01524 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms