Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMARCA2P51531 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMARCA2P51531 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms