Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ABCC11-204ENST00000394748 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZNF226-215ENST00000590089 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 EARS2-207ENST00000563459 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DENND1B-201ENST00000235453 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC009264.1-205ENST00000439694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ACSM5P1-201ENST00000566754 2438 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PHC1-201ENST00000433083 5033 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC00954-201ENST00000433669 2472 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PDZRN3-203ENST00000462146 2927 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 WNT3-201ENST00000225512 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CHRNA2-202ENST00000407991 4067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CNBD2-201ENST00000349339 1927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC00857-201ENST00000422847 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 IFIT5-201ENST00000371795 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZC2HC1C-203ENST00000524913 4283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 MTND6P16-201ENST00000504006 520 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AL356234.1-201ENST00000404534 1779 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AL121895.1-202ENST00000441208 2701 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AC092645.1-201ENST00000624058 2272 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC01012-204ENST00000629732 2771 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AL353759.1-201ENST00000635439 1578 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PAX6-282ENST00000640975 2553 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 UPK1B-201ENST00000264234 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PCP4P48539 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 GINS3-202ENST00000328514 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC01940-201ENST00000455228 3489 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 USP35-201ENST00000526425 3770 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 FCRL3-201ENST00000368184 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 LINC01845-201ENST00000518418 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 ZNF226-202ENST00000337433 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PCP4P48539 DLGAP1-AS5-202ENST00000565811 2594 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms