Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFSF9P41273 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms