Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC13P31276 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXC13P31276 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXC13P31276 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXC13P31276 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms