Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TSPOP30536 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TSPOP30536 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TSPOP30536 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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