Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF2E1P29083 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms